A lo largo de la historia el club ha tenido varias secciones que actualmente están desaparecidas: baloncesto (masculino y femenino), atletismo, ajedrez y, más recientemente, fútbol sala femenino. La temporada 2001/02, con la vuelta a la competición del equipo sénior de la Unión, el UD Seislán pasó únicamente a gestionar equipos de fútbol base. Los estatutos del UD Seislán fueron aprobados por la Delegación Nacional de Educación Física y Deportes el 10 de enero de 1975. Entre 1975 y 2001 actuó de facto como el primer equipo del UD Mahón, tercera equipacion barcelona al que la Federación de Baleares no permitía competir en categoría sénior.
