Para las Clasificatorias a Sudáfrica 2010, Bravo ya estaría algo consolidado como el primer arquero de la selección y se convertiría en el capitán del equipo a partir de la Fecha 5 tras el retiro internacional de Marcelo Salas. Con Marcelo Bielsa al mando de la selección lograrían una histórica clasificación al Mundial de Sudáfrica en el segundo lugar con 33 puntos, siendo superados solo por el pentacampeón mundial Brasil y con Bravo jugando los 18 partidos rumbo a Sudáfrica, en su camino a la clasificación lograron triunfos vitales como contra Bolivia (2-0) en La Paz, Venezuela (3-2) en Puerto La Cruz, Perú (3-1) en Lima, Paraguay (2-0) en Asunción (primer triunfo de la selección en tierras paraguayas en 28 años), camiseta del barça Colombia (4-2) en Medellín (que significa la clasificación al mundial luego de 12 años).